A Dentre as vantagens da citometria de fluxo, podemos citar o uso simultâneo de marcadores múltiplos além de análises qualitativas e quantitativas multivariada dos dados e análise de populações heterogêneas e polimicrobianas.

B Dependendo da variante, alguns corantes permitem distinguir células viáveis das não viáveis em uma suspensão.

C Algumas variantes metodológicas permitem o uso de marcadores diversos para pH, antígenos, lipídeos, polímeros de carboidratos, sequências nucleotídicas, DNA, RNA, proteínas, atividade enzimática e antígenos, separados ou combinados.

D A metodologia permite a separação de células de dimensões distintas em diferentes coletores.

E Uma limitação do método é a impossibilidade de monitoramento das terapia antimicrobiana em um quadro infeccioso com a análise direta do espécime clínico como flúidos e exsudatos.